Responsable : Dr. Marc Emmanuel Dumas
Le plateau métabolome répond au besoin d’installer une thématique de métagénomique par séquençage shotgun en créant notamment une synergie avec la plateforme LIGAN-PM. Ce plateau technique reposera sur du matériel de pointe (spectromètres de masse dernière génération notamment), la mise en place d’une librairie de standards chimiques purs pour plus d’un millier de métabolites et lipides, et du personnel dédié hautement qualifié.
L’ensemble permettra l’obtention de données scientifiques de grande valeur sur l’ensemble de nos projets. Ces données seront alors analysées grâce à l’implémentation d’un pipeline bioinformatique de traitement de séquences métagénomiques. Ce dernier permettra d’intégrer le métabolome, le métagénome et le génome de l’hôte afin de cartographier et d’exploiter les richesses, encore largement inconnues, de notre pharmacopée intestinale, réservoir de substances naturelles bioactives biosynthétisées par le microbiome au potentiel encore largement inexploré.
